Το τμήμα Επιτραπέζιας Αντισφαίρισης της ΑΕΚ, ιδρύθηκε το 1930 και λειτούργησε έως το 1986. Σε αυτό το διάστημα κατέκτησε την 3η θέση σε Άνδρες και Νέους (1959) και την 3η θέση στο Κύπελλο Ελλάδος (1984, 1985).
Το 2009 επανιδρύθηκε το ανδρικό τμήμα και το 2011 δημιουργήθηκε και γυναικεία ομάδα. Η ανδρική ομάδα έχει κατακτήσει 2 Πρωταθλήματα Ελλάδος (2019, 2020) και μάλιστα το δεύτερο αήττητη, ενώ η γυναικεία ομάδα ανέβηκε για πρώτη φορά στην ιστορία της στην κορυφαία κατηγορία της χώρας το 2020.
Προπονητήριο του τμήματος είναι το 3ο Γυμνάσιο Νέας Φιλαδέλφειας.
